Si, es posible hacer la carga de tu tarjeta SUBE usando Pago Mis Cuentas.

Es muy fácil:

1 - En el menú dentro de Pago Mis Cuentas seleccioná la opción "Recargar".
2 - Hacé clic en Transporte y elegí el servicio a recargar.
3 - Llená los datos y hacé clic en el botón "Recargar".
4 - ¡Listo!